微生物扩增子测序数据分析培训的通知
发布日期:2024-05-07 14:58:45
微生物扩增子测序数据分析培训的通知
根据“南极长城极地生态国家野外科学观测研究站”的培训安排,极地中心近期将举办一次关于微生物扩增子测序技术的培训会议。此次培训旨在提升科研人员的数据分析能力,更准确、深入地解析微生物群落多样性。
一、会议时间
2024年5月17日(星期五)9:00-17:00
二、会议地点
线下会议地址:极地中心 (金桥院区)(上海市浦东新区金桥路451号)A601会议室。
三、培训内容及安排
时间 | 主题 | 简介 |
9:00-10:20 | 测序仪器 | 二代、三代测序仪、测序流程 |
样本提取 | DNA抽提原则,判断标准 | |
扩增子介绍 | 背景知识、分析原理、科学问题 | |
10:30-12:00 | 扩增子分析流程 | 1.数据质控,实验设计,双端序列合并 |
2.提取barcode,质控及样品拆分,切除扩增引物 | ||
3.格式转换,去冗余, 聚类生成OTU或去噪生成ASV | ||
13:30-15:00 | 4.去嵌合体,非细菌序列,生成代表性序列和OTU表 | |
5.物种注释,OTU表操作 | ||
6.多样性分析 | ||
7.物种分类统计 | ||
8.功能预测 | ||
15:20-17:00 | 文章图表 | 常用分析图表在文章中意义和使用场景 |
数据上传 | NCBI数据库上传原始数据 |
四、培训对象
本次培训面向全国的具备一定的生物学基础和实验操作经验的科研人员。
五、注意事项
(一)培训所有数据,文档为内部资料,仅供参阅,未经允许不得翻印外传登刊。
(二)参加培训人员需自带电脑,推荐使用Win10系统,8G内存。
(三)Linux及R语言基本操作、代码及程序安装需提前学习掌握,不再培训。
七、报名方式
本次会议采用线上和线下结合的方式同时进行,点此或扫描下方二维码报名参与:
(一)请参会人员密切关注邮箱,线上参与方式将通过报名邮箱发送。
(二)本次培训线下参加人数有限,满50人自动截止。
八、培训费用
本次培训无培训费,食宿自理。
九、会务联系人
王正, 电话:15237306010,邮箱:wangzheng01@pric.org.cn
来源:中国极地研究中心(中国极地研究所)